尽管警方尚不清楚“哈里发国马来群岛部队”是否存在，但根据现有迹象观察，马来西亚极端武装分子与印尼极端武装分子确有合流的迹象。马来西亚国防卫队首长祖基菲里警告说，“这些武装分子已对马来西亚构成直接威胁”。

此间马来西亚《星洲日报》报道称，祖基菲里27日对《新海峡时报》说，“如果我们不够谨慎，那(被攻击)只是时间问题”。

他说，警方将会全面监控那些涉嫌于“哈里发国”有联系的马来西亚人，包括支持及援助中东作战的马来西亚武装分子。“我们会全面追查那些进行恐怖活动的人士”。

据此间马来语报纸《每日新闻》援引消息称，除了马来西亚、印尼和菲律宾，“哈里发国马来群岛部队”也招募新加坡的武装分子。

报道说，这几个国家的武装分子之所以组合在一起，是因为各自能够用马来语沟通。在作战时不会出现沟通障碍。

9月25日，马来西亚警方在吉隆坡国际机场逮捕3名前往中东参加“圣战”的马来西亚武装分子。据悉，马来西亚已有5名极端分子战死在中东。