世卫组织建议，如果动物养殖场所疑似出现疫情，应立即对相关场所实施隔离，扑杀并掩埋被感染动物或焚烧动物尸体，以降低感染人类的风险。预防或降低人群感染的有效方法是增进对该病毒传染途径的了解，预防措施包括食用水果前彻底清洗并去皮；处理患病动物及其组织时，应穿防护服并佩戴手套；避免与尼帕病毒感染者进行无防护的密切接触等。

世卫组织在2018年发布的“研发蓝图”将尼帕病毒列为需重点关注的传染病威胁之一，对于该病毒引发的严重呼吸系统和神经系统并发症，建议采取强化的支持性护理。该组织还建议，由于尼帕病毒疫情的暴发涉及多种动物，建立动物健康监测系统并采用“一体化卫生”方法来发现尼帕病毒感染病例至关重要，可为兽医和人类公共卫生部门提供预警。

《自然-健康》杂志文章介绍，流行病防范创新联盟将持续推动支持尼帕病毒防控措施、诊断和疫苗开发的工作。该联盟已拨款支持相关科学项目，旨在建立尼帕病毒检测标准，推进检测方法开发，并促进疫苗开发。

马来西亚大学研究人员强调，医疗人员、兽医和野生动物专家在调查新发传染病时应保持开放态度、密切合作与协调。人畜共患病毒还警示了环境管理不当产生的深远影响，可能造成野生动物侵入人类栖息地并将人畜共患疾病引入家畜和人类之中。

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